Strax före klockan 04 fick polisen in larm om att en person hade blivit utsatt för ett grovt brott i centrala Stockholm.
– Det rör sig om en omyndig person och vi har gripit en man i 40-årsåldern misstänkt för brott, säger polisens presstalesperson Mats Eriksson.
Den målsägande är enligt Expressen en tonårspojke under 15 år. Mannen har under fredagseftermiddagen anhållits misstänkt för våldtäkt, rapporterar P4 Stockholm.
Polisen misstänker att brottet har skett utomhus.
Avspärrningarna som sattes upp runt område vid Kungsgatan och Vasagatan hävdes vid 07-tiden.
Polisen ska hålla förhör med den misstänkte mannen.