Larmet till polisen kom strax innan klockan 01.
– Jag kan bekräfta att en man i 30-årsåldern gripits, misstänkt för att ha våldtagit en vuxen kvinna i krog- och restaurangmiljö, säger Helena Boström Thomas, presstalesperson vid polisen.
Brottsplatsen spärrades av för att undersökas. En förundersökning om våldtäkt har inletts.
Mannen kunde gripas på plats.
– Vi har hört personer som var där och kollat kameror. Vi har utfört sedvanliga utredningsåtgärder när det handlar om så här grova, misstänkta brott.
Händelsen ska ha inträffat på centrala Södermalm.