Hammarby TFF var inne i en bra period, med sex matcher utan förlust, innan uddamålsförlusten mot FC Stockholm i näst senaste omgången.
I hemmamötet mot nedflyttningshotade Motala AIF var Hammarby TFF på jakt efter revansch men förlorade mot ett effektivt Motala AIF.
Hammarby TFF radade upp målchanser under matchen, bland annat genom Hampus Söderström som hade en ribbträff och en nick på mållinjen, medan Motala AIF tog vara på målchanserna.
Albin Ödberg gjorde ledningsmålet ett skott som styrdes i mitten av första halvleken innan Kevin Ali punktera matchen via en snabb omställning i slutet av matchen.
Hammarby TFF möter Umeå FC på bortaplan i nästa omgång.